पिछले साल, पैथोलॉजिस्ट जेफरी सोरेल, एमडी, और उनके सहयोगियों ने CoVarScan विकसित किया, जो एक तेजी से COVID-19 परीक्षण है जो SARS-CoV-2 वायरस में आठ हॉटस्पॉट हस्ताक्षरों का पता लगाता है।
अब जब यूटी साउथवेस्टर्न में एकत्र किए गए 4,000 से अधिक रोगी नमूनों पर CoVarScan का परीक्षण किया गया है, तो क्लिनिकल केमिस्ट्री की टीम रिपोर्ट करती है कि इसका परीक्षण COVID-19 के निदान के अन्य तरीकों की तरह ही सटीक है और COVID-19 के सभी मौजूदा वेरिएंट के बीच सफल अंतर कर सकता है।
पैथोलॉजी के सहायक प्रोफेसर और अध्ययन के वरिष्ठ लेखक डॉ सोरेल ने कहा, “इस परीक्षण का उपयोग करके, हम बहुत जल्दी यह निर्धारित कर सकते हैं कि समुदाय में कौन से प्रकार हैं और यदि कोई नया संस्करण उभर रहा है।”
“यह व्यक्तिगत रोगियों के लिए भी प्रभाव डालता है जब हम ऐसे रूपों से निपट रहे हैं जो उपचार के लिए अलग-अलग प्रतिक्रिया देते हैं।”
यूटी साउथवेस्टर्न के वन्स अपॉन ए टाइम ह्यूमन जीनोमिक्स सेंटर में परीक्षण के परिणामों ने सार्वजनिक स्वास्थ्य नेताओं को उत्तरी टेक्सास में COVID-19 के प्रसार को ट्रैक करने और वेरिएंट के प्रसार के आधार पर नीतिगत निर्णय लेने में मदद की है।
डॉक्टरों ने परिणामों का उपयोग मोनोक्लोनल एंटीबॉडी चुनने के लिए भी किया है जो गंभीर रूप से बीमार COVID-19 रोगियों को संक्रमित करने वाले कुछ उपभेदों के खिलाफ अधिक प्रभावी हैं।
जबकि COVID-19 के लिए कई अन्य परीक्षण मौजूद हैं, वे आम तौर पर या तो SARS-CoV-2 आनुवंशिक सामग्री के टुकड़े या वायरस की सतह पर पाए जाने वाले छोटे अणुओं का पता लगाते हैं, और प्रकार की पहचान करने के लिए जानकारी प्रदान नहीं करते हैं।
इसके अलावा, कई शोधकर्ता चिंता करते हैं कि ये परीक्षण कुछ प्रकारों का पता लगाने में सटीक नहीं हैं – या भविष्य के उपभेदों को याद कर सकते हैं।
यह निर्धारित करने के लिए कि एक मरीज के पास COVID-19 का कौन सा प्रकार है, वैज्ञानिकों को आमतौर पर पूरे-जीनोम अनुक्रमण का उपयोग करना चाहिए, जो कि समय लेने वाली और महंगी है, जो परिष्कृत उपकरणों और विश्लेषण पर निर्भर करती है ताकि वायरस में निहित संपूर्ण आरएनए अनुक्रम का पता लगाया जा सके।
2021 की शुरुआत में, डॉ. सोरेले और उनके सहयोगियों ने यूटी साउथवेस्टर्न में यह ट्रैक करना चाहा कि वर्तमान परीक्षण SARS-CoV-2 के उभरते हुए रूपों का कितनी अच्छी तरह पता लगा रहे हैं।
लेकिन उन्होंने महसूस किया कि बहुत सारे नमूनों का अनुक्रमण समय पर या लागत प्रभावी नहीं होगा, इसलिए उन्होंने मैकडरमोट सेंटर नेक्स्ट जेनरेशन सीक्वेंसिंग कोर में काम करते हुए, हेलेन हॉब्स द्वारा निर्देशित यूजीन मैकडरमोट सेंटर फॉर ह्यूमन ग्रोथ एंड डेवलपमेंट के हिस्से में काम करते हुए अपना खुद का परीक्षण तैयार किया। , एम.डी., आंतरिक चिकित्सा और आणविक आनुवंशिकी के प्रोफेसर।
CoVarScan SARS-CoV-2 के आठ क्षेत्रों में काम करता है जो आमतौर पर वायरल वेरिएंट के बीच भिन्न होते हैं।
यह छोटे म्यूटेशन का पता लगाता है – जहां आरएनए बिल्डिंग ब्लॉक्स का क्रम बदलता रहता है – और दोहराए जाने वाले आनुवंशिक क्षेत्रों की लंबाई को मापता है जो वायरस के विकसित होने पर बढ़ने और सिकुड़ने की प्रवृत्ति रखते हैं।
विधि पोलीमरेज़ चेन रिएक्शन (पीसीआर) पर निर्भर करती है – अधिकांश पैथोलॉजी लैब में एक सामान्य तकनीक – रुचि के इन आठ स्थलों पर आरएनए की प्रतिलिपि बनाने और मापने के लिए।
CoVarScan कितनी अच्छी तरह काम करता है, इसका परीक्षण करने के लिए, डॉ सोरेल की टीम ने अप्रैल 2021 से फरवरी 2022 तक यूटी साउथवेस्टर्न में एकत्र किए गए 4,000 से अधिक COVID-19-पॉजिटिव नाक के स्वाब नमूनों पर परीक्षण चलाया – दोनों लक्षणों वाले और बिना लक्षणों वाले रोगियों से।
परीक्षणों को स्वर्ण-मानक पूरे-जीनोम अनुक्रमण के साथ मान्य किया गया था, और परिणामों का उपयोग डॉक्टरों द्वारा कुछ गंभीर रूप से बीमार COVID-19 रोगियों के उपचार का चयन करने के लिए किया गया था।
संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमण की तुलना में, CoVarScan में 96% संवेदनशीलता और 99% विशिष्टता थी।
इसने COVID-19 के डेल्टा, म्यू, लैम्ब्डा और ओमिक्रॉन वेरिएंट की पहचान की और उनमें अंतर किया, जिसमें ओमाइक्रोन का BA.2 संस्करण भी शामिल है, जिसे कभी “स्टील्थ ओमाइक्रोन” के रूप में जाना जाता था, क्योंकि यह केवल ओमाइक्रोन स्ट्रेन का पता लगाने के लिए डिज़ाइन किए गए कुछ परीक्षणों पर दिखाई नहीं देता था। .
“इस तरह के परीक्षण की एक आम आलोचना यह है कि इसे नए वेरिएंट के लिए निरंतर समायोजन की आवश्यकता होती है, लेकिन CoVarScan को एक वर्ष से अधिक समय में किसी भी समायोजन की आवश्यकता नहीं है; यह अभी भी बहुत अच्छा प्रदर्शन कर रहा है,” डॉ सोरेले ने कहा।
“भविष्य में, अगर हमें इसे समायोजित करने की आवश्यकता होती है, तो हम आसानी से परीक्षण में 20 या 30 अतिरिक्त हॉटस्पॉट जोड़ सकते हैं।”
डॉ. SoRelle की योजना CoVarScan को एक व्यावसायिक परीक्षण के रूप में विकसित करना जारी रखने की है और इस कार्य के आधार पर उसके पास एक लंबित पेटेंट आवेदन है।
वेरिएंट के लिए जीनोटाइपिंग पीसीआर टेस्ट के आविष्कारक के रूप में, डॉ सोरेल इसके उपयोग से आय के हकदार हैं।
अध्ययन UTSW शोधकर्ताओं द्वारा तेजी से COVID-19 परीक्षण के विकास को दर्शाता है जो घंटों में वेरिएंट की पहचान कर सकता है
